1.1 煤炭建设项目管理体制老化
到目前为止，较多煤炭企业内煤炭项目的建设依然是按照惯例来进行的，在这样一种体制下，建设单位往往就会成为整个过程中的投资主体，无论是前期的论证工作还是项目竣工以后的投产都是由建设单位自行进行和控制，这样一种发展与建设模式无疑是缺乏良好的监督和管理的，会进一步的导致建设单位在进行施工的过程中片面的追求安全生产，而对于整体的投资和工期重视不够，且缺乏必要的节约意识，在总体的效益控制上缺乏意识。除此之外，上级综合管理部门往往对建设单位从建设到竣工的整体生产过程和情况都没有准确的认识和了解，最终造成了监管不到位的状况。
1.2 煤炭建设项目工程造价管理模式上的不足
这主要是因为煤炭行业现行工程造价的确定方法在一定程度上落后了，在大部分的煤炭建设工程中都还是采用的定额计价模式，这样一种计价模式与国际通行的工程量清单计价模式相比就显得具有价格相对滞后、综合程度大且难以体现市场竞争的公平性等一系列的缺点。
1.3 设计阶段缺乏必要的监督与管理
在实际的设计与建设过程中，设计阶段对整个工程造价的影响大约在50%左右，而施工阶段对于工程造价的影响则保持在10%左右，由此就不难看出设计阶段控制管理的必要性。但是在现行的管理制度下，设计工作并没有得到其应有的重视和监督，这样一种不足的出现和存在主要就是因为建设单位本身没有采取应用的措施来保证设计单位能够尽心尽力的去精心设计和限额设计。从本质上来讲，工程项目的建设都是应该经过严格的可行性研究和投资额度的审批程序以后才能够予以实施的，且在工程建设的各个阶段内还需要对工程造价实现额度控制，强调精心的准备、科学的组织、合理的实施以及严格的控制，只有通过这样一种良好的管理与控制才能最终实现煤炭生产的高效、安全和经济。但在实际的建设条件下，建设单位往往由于工期的限制和要求而违背了基建的基本程序，极大程度的忽视了额度的要求和建筑标准的高低，在施工的过程当中并没有设计、招标以及承包合同等进行严格的把关，以至于实际施工过程中“边施工变变更”和“先开工、后设计”的现象普遍存在。而设计单位本身由于时间上的限制，也很难及时的了解整个工程的实际状况，设计中就难免出现漏项和多项的现象，使得设计的变更相对滞后。
再者就是煤炭建设工程受工程地质条件的影响比较大，因为这样一些方面的原因而导致的工程变更也是相当之多的，这同样也是因为煤炭建设工程自身特殊性所致，往往造成的结果也就是设计变更的滞后性。在煤炭建设工程当中，经常就会有设计单位出具设计变更的巷道变更，且设计变更往往都要等到竣工结算以后才能够进行，这导致的结果就是投资超概算的责任相当不清楚，导致投资确认以及工程验收等多方面工作的难度不断加大。
1.4 项目管理缺乏专业人才
煤炭企业本身属于高危行业，因此从业的人员也相对缺乏、人员素质也有待提高，尤其是在基本建设项目的管理中更是缺乏专业的人才。人员素质上的缺乏无疑会导致整个工程质量上的不高，往往就会出现设计上的偏差、质量上的欠缺、进度上的不足以及经济意识上的不强，这样一系列的问题都在一定程度上制约了基本建设项目的建设的后续的良好发展。
1.5 基建转生产的时机把握不准
基建转生产时机上的把握不到位会较大程度的增加整个工程不必要的损失。有些时候因为基建转生产的时机不到位甚至会导致建设单位在基建的中期就转入到生产的状态中来，并随意的更改既有的初步设计，队伍相应的大幅扩增，这样一种不良状况的出现一方面是会加大单位管理的费用，另一方面会导致生产开支与基建投入上的混淆不清，容易将整个局面搅和的相当混乱。除此之外，有些单位的基建甚至于生产是完全脱节的，使得整个过程当中队伍进驻较慢、人员不足且生产的条件非常差。
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